Em biotecnologia, o conhecimento e manipulação da reprodução vegetal é sem dúvida o mais importante alvo do melhoramento pelo fato de estar diretamente relacionada ao aumento da produção. O mais conhecido exemplo de sucesso nessa área foi o desenvolvimento de plantas macho-estéril, que permitiu a utilização na agricultura de sementes híbridas. Além dos aspectos relacionado a produção, outro ponto importante dentro do estudo e manipulação do sistema reprodutivo vegetal é a contensão gênica de cultivos transgênicos. Esse problema é ainda mais crítico quando se considera a possibilidade do cultivo de arbóreas transgênicas pela maior capacidade de dispersão do pólen. Apesar dessa importância, existem várias lacunas no conhecimento básico do sistema reprodutivo em plantas assim como não há registro de pesquisas em andamento no Brasil para manipulação do sistema reprodutivo em espécies economicamente importantes.

Objetivos
   Dentro dessa perspectiva, temos como objetivos neste projeto:
1 - Identificar os ortólogos funcionais em espécies com importância econômica como o eucalipto para os genes chave da identidade floral como APETALA1 (AP1) e APETALA3 (AP3). Esses genes poderão, numa etapa seguinte, ser utilizados no melhoramento genético da espécie cultivada;
2 - Identificar novos genes expressos durante o desenvolvimento do estame em Arabidopsis, através da combinação da utilização de micro arranjos e mutantes do desenvolvimento do estame;
3 - Estudo da função dos novos genes identificados durante o desenvolvimento de estame através da caracterização do padrão de expressão assim como do fenótipo de linhagens knock-out para estes genes.
             
Subprojetos desenvolvidos ou em desenvolvimento:
1 - Identificação e análise de genes que possuem a seqüência consenso MADS box em eucalipto
Equipe: Beatriz Fonseca de Oliveira Dias, Dr. Jean Luiz Simões-Araújo, Dra. Claudia A.M. Russo, Dr. Rogério Margis, e Dr. Márcio Alves-Ferreira (Coordenador)
Apoio: Consorcio FOREST
Situação: Realizado (2003)
2 - Pesquisas em genoma funcional em câncer, AIDS e biotecnologia (projeto multi-usuário)
Equipe: Dra. Ana Coelho, Dra Ieda Orioli, Dr. Amílcar Tanuri, Dr. Marcio Alves Ferreira e Dr. Hector Suanez(Coordenador);
Sub-projeto: Identificação  de genes expressos durante as fases iniciais de desenvolvimento do estame em A. Thaliana com a utilização de microarrays.
Equipe: Graça C. G. da Rocha, Beatriz Fonseca de Oliveira Dias, Samara Braga Nascimento, Pablo Miranda Silva e Marcio Alves Ferreira(Coordenador)Apoio: PADCT/FAPERJ
Situação: Realizado (2002-2004)
3 - Identificação de genes expressos durante as fases iniciais de desenvolvimento do estame em A. thaliana com a utilização de microarrays. (Projeto individual)
Equipe: Dra. Graça C. G. da Rocha, Beatriz Fonseca de Oliveira Dias, Samara Braga Nascimento, Pablo Miranda Silva e Dr. Marcio Alves Ferreira (Coordenador)Apoio: PADCT/FAPERJ
Situação: Realizado (2002-2004)
4 - Genômica funcional da reprodução vegetal: Aplicação biotecnológica e caracterização de novos genes
Equipe: Elisson Romanel, Aline Banhara, Diana Ciannella e Dr. Marcio Alves Ferreira(Coordenador)
Apoio: CNPq (Edital Universal) e FAPERJ (APQ1)
Situação: Em desenvolvimento (2004-2006)
5 - Functional genomics of stamen in the model plant Arabidopsis thaliana with the aim of devising strategies for gene-contaiment in Genetically Modified crops
Equipe: Elisson Romanel, Aline Banhara, Diana Ciannella e Dr. Marcio Alves Ferreira(Coordenador)
Apoio: International Foundation for Science (IFS)
Situação: Em desenvolvimento (2005-2006)
6 - Identificação e caracterização de seqüências de cDNA de Brachiaria relacionadas a apomixia
Equipe: Erica Silveira, Dr. Marcio Alves Ferreira e Dra. Vera Tavares(Coordenadora)
Apoio: CNPq/CBAB
Situação: Em desenvolvimento (2004-2008)