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Este laboratório já teve trabalhos realizados com diversos organismos e temas da Genética de Microrganismos. Foi estudado o mecanismo de transposição do bacteriófago Mu. Posteriormente foram isolados e estudados elementos de transposição de Salmonella typhimurium. Entre estes, o Tn4527, se mostrou um transposon único, por ser constituido por partes semelhantes ao conhecido transposon Tn7, incluindo algumas de suas proteinas envolvidas na transposição, mas ao mesmo tempo sendo flanqueado por sequências de inserção em repetição direta, sequências estas praticamentes iguais ao IS1. Isto modifica o modo de transposição do transposon.
Mais recentemente o laboratório tem concentrado seus esforços em diversos aspectos da Genética Bacteriana e Microbiologia estudados usando como modelo a bactéria Vibrio cholerae. Esta espécie bacteriana tem aspectos muito interessantes, que mostram uma grande versatilidade em seu modo de vida. Ao mesmo tempo que algumas linhagens dessa espécie são patogênicas para o homem e causam epidemias de cólera, esta espécie está normalmente espalhada na natureza, estando presente em ambientes aquáticos, estuarinos e marinhos. Além disso existem associações da mesma com invertebrados marinhos tais como copépodos e ainda com plantas aquáticas. Isto permite uma integração multidisciplinar da Genética, Microbiologia, Ecologia e Epidemiologia.
Conexões imediatas
UFRJ, Instituto de Biologia, Departamento de Genética
Pós-graduação em Genética Página de Ana Coelho
Membros
Professores
Ana Maria Abrantes Coelho, coelho@biologia.ufrj.br, fone 2562-6382
Pós-graduandos
Sonia Catarina de Abreu Figueiredo (doutorado)
Mauro Luiz da Hora Faria (mestrado)
Aperfeiçoamento
Hebert Hernan Soto Gonzales
Iniciação científica
Eidy de Oliveira Santos- I. Biologia da UFRJ
Ingrid Horbach- I. Biologia da UFRJ
Rodrigo Agrellos- I. Biologia da UFRJ
Auxiliar de Laboratório:
João Batista Gonçalves
Colaboradores
Dra. Ana Carolina P. Vicente - Dep. Genética - Instituto Oswaldo Cruz
Dr. João R.C. Andrade- Serviço de Microbiologia e Imunologia - Univ. Estado do Rio de Janeiro
Dr. Victor DiRita - Dept. Microbiology and Immunology and Unit for Laboratory Animal Medicine - University of Michigan, Ann Arbor
Dr. Cesare Montecucco- Dipartimento de Scienze Biomediche Sperimentali- Università degli Studi di Padova, Padova, Itália
- ANÁLISE DA ESTRUTURA GENÔMICA DE VIBRIO CHOLERAE
DNA repetitivo. Localização e sequenciamento.
Técnicas de análise global de genoma (RAPD, ERIC-PCR).
DNA ribossômico.
- ESTUDO DE GENES DE VIRULÊNCIA
Detecção da presença e estudo do modo de atuação de genes de virulência em linhagens patogênicas e ambientais. Entre os genes estudados estão os da toxina colérica, o da toxina termo-estável, tcpA, e os genes regulatórios toxR e toxT.
- EXPRESSÃO GÊNICA DE V. CHOLERAE
Expressão gênica de V. cholerae no meio ambiente.Visa a detecção de genes induzidos especificamente na interação de V. cholerae com o ambiente, e particularmente em associações com hospedeiros tais como invertebrados marinhos.
Expressão de genes de virulência.
- ESTUDO MOLECULAR DA VARIANTE AMAZÔNIA DE V. CHOLERAE.
Este variante de V. cholerae O1 patogênico foi descrito por nosso grupo e descoberto a partir de um conjunto de linhagens provenientes de S. Paulo de Olivença (Amazonas). Elas são não toxigênicas e provocam, num sistema de alça intestinal de coelhos, uma destruição do tecido epitelial e acúmulo de muco, ao invés do efeito usual de acúmulo de líquido. Queremos investigar por técnicas de DNA alguns genes de virulência deste variante de V. cholerae, com o objetivo de estudar o modo de patogenicidade deste organismo.
- HEMOLISINA DE V. CHOLERAE
Estudamos a atividade citotóxica do sobrenadantes de linhagens Amazonia de V. cholerae, e verificamos que em baixas concentrações esta atividade causava a formação de vacúolos em células de mamíferos. Verificamos posteriormente que a atividade formadora de vacúolos é a hemolisina de V. cholerae. Queremos examinar o modo de formação destes vacúolos.
- BIODIVERSIDADE DE V. CHOLERAE
Diversidade molecular de Vibrio cholerae ambientais no Estado do Rio de Janeiro. Estamos fazendo o isolamento de V. cholerae a partir de amostras ambientais coletadas em manguezais e principalmente a partir de invertebrados marinhos, tais como moluscos e caranguejos.
Estudo de metodologias moleculares para estudos de biodiversidade (RAPD, ERIC-PCR).
- TAXONOMIA DO GÊNERO VIBRIO
Isolamento e taxonomia clássica de Vibrios ambientais.
Taxonomia molecular de Vibrios ambientais.
- DNA RIBOSSÔMICO DE VIBRIOS
Sequenciamento de rDNA e amplificação por PCR de regiões variáveis.
Análise do tamanho da região variável V1 do RNA ribossômico 16S de diferentes espécies.
Estudos com SSCP para diferenciação de genoespécies.
- Role of the G segment in the growth of phage Mu (1978) N. Symonds e Ana Coelho. Nature 271 (5645) 573-574.
- The Isolation and Characteristics of Plasmids Derived from the Insertion of MupAp1 into pML2: their behaviour during Transposition (1980) S.Maynard-Smith, D.Leach, Ana Coelho, J. Carey e N. Symonds. Plasmid 4, 34-50.
- Transposition Studies Using a Col E1 Derivative Carrying Bacteriophage Mu (1980) Ana Coelho; D. Leach; S. Maynard-Smith e N. Symonds. Cold Spring Harbor Symp.on Quant. Biol. 45, 323-328.
- Analysis of Proteins Synthesized by Plasmids Containing Cloned Fragments of Bacteriophage Mu (1981) Ana Coelho e N. Symonds. FEMS Microbiology Letters 11, 101- 106.
- Abnormal Cointegrate Structures Formed by Gene B Mutants of Phage Mu (1982) Ana Coelho; S.Maynard-Smith e N.Symonds. Molec. Gen. Genetics 185, 356-362.
- Transposons: a Dança dos Genes (1986) Ana Coelho. Ciência Hoje 4 (22), 36-41.
- The isolation of a 20kb transposon, Tn4527, carrying resistance to trimethoprim, spectinomycin and streptomycin (1989) AT Dumans e A. Coelho. Rev. Bras. Genética 12, 189- 200.
- Tn4527, a Tp Sp/Sm transposon related to Tn7 and flanked by IS1 (1989) AT Dumans, MF Carvalho e A. Coelho. Plasmid 22, 256-259.
- Vibrio cholerae in South America: PCR and zymovar analysis. (1993) Salles, CA; H Momen, ACP Vicente e Ana Coelho. Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene 87, 272.
- An analysis of the V1 and V2 regions of the Vibrio cholerae and Vibrio mimicus 16S rRNA. (1994). Coelho, A; Momen, H; Vicente, ACP e Salles, CA. Research in Microbiology 145:151-156.
- Bengal: El Tor cholera in a new robe.(1994) Salles, CA; Momen, H; Coelho, A; Oliveira, EF e Vicente, AC, Balakrish Nair, G. Memórias do Inst. Oswaldo Cruz 89 (1):115-116.
- A new variant of Vibrio cholerae O1 from clinical isolates in Amazonia. (1995) Coelho, A; J.R.C. Andrade, A. C. P. Vicente e C.A. Salles. Journal of Clinical Microbiology 33:114-118.
- The distinction of pathogenic Vibrio cholerae groups using arbitrarily primed PCR fingerprints. (1995) Coelho, A; A.C.P. Vicente; M.A.S. Baptista; H. Momen; FARW Santos and C.A. Salles. Res. Microbiology 146:671-683.
- Effect of glucose on photodynamic action of methylene blue in Escherichia coli cells. (1996) Capella, M; Coelho, AM and Menezes, S. Photochemistry & Photobiology 64:205-210.
- Genomic fingerprints of Vibrio cholerae using arbitrary primer PCR are useful epidemiological tools. (1997) Coelho, A, JRC Andrade, MAS Baptista, ACP Vicente, LR Ferraz e CA Salles. In Cytokines, Cholera and the Gut, ed. GT Keusch & M Kawakami, IOS Press, Estados Unidos, cap.28, pp.203-211.
- Molecular characterization of TCP cluster in non-O1, non-O139 Vibrio cholerae. (1997) Vicente, ACP, Novaes, RC, Coelho, A e Salles, CA. In Cytokines, Cholera and the Gut, ed. GT Keusch & M Kawakami, IOS Press, Estados Unidos, cap. 33, pp.243-248.
- Detection of Vibrio cholerae and Vibrio mimicus heat- stable toxin gene sequence by PCR. (1997) Vicente, ACP, Coelho, A & Salles, CA. J. Med. Microbiol. 47:398-402.
- The Amazonia variant of Vibrio cholerae: molecular identification and study of virulence genes. (1998) Baptista, MAS, Andrade, JRC, Vicente, ACP & Coelho, A. Memorias do Instituto Oswaldo Cruz 93(5):601-607.
- Toxin-co-regulated pilus cluster in non-O1, non-toxigenic Vibrio cholerae: evidences of a third allele of the pilin gene. (1999) Novais, RC, Coelho, A, Salles, CA &Vicente, ACP. FEMS Microbiology Letters 171:49-55.
- Cytotoxic cell vacuolating activity from Vibrio cholerae hemolysin (2000) Coelho, A, JRC Andrade, ACP Vicente & VJ DiRita. Infection & Immunity 68(3):1700-1705.
- É verdade que, na atual classificação dos seres vivos, existe um novo reino que inclui as bactérias encontradas nas geleiras da Antártica? (2000) Coelho, A. Ciência Hoje 27 (162) 8.
- Qual a relação entre os elementos transponíveis e a resistência de bactérias a antibióticos? (2001) Coelho, A. Ciência Hoje 29 (170):4-5.
- "Red complex" (Bacteroides forsythus, Porphyromonas gingivalis, and Treponema denticola) in endodontic infections: A molecular approach. (2001) Roças IN, Siqueira JF Jr, Santos KR, Coelho AM. Oral Surg Oral Med Oral Pathol Oral Radiol Endod. 91(4):468-71.
Sequências depositadas no GENBANK
- 16S rRNA gene de Vibrio cholerae (parcial): acesso L05178, de 1992.
- Sequencia completa do gen da hemolisina (hlyA) da variante Amazonia de Vibrio cholerae: acesso AF194418, de 1999.
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Tese de mestrado orientadas por Ana Coelho:
- Ana Teresa Nogueira Dumans. Bolsa: CNPq. Março de 1984 a outubro de 1988.
- Ludmila Mueller Costa de Castro Leal. Bolsa: CAPES. Março de 1984 a agosto de 1987.
- Vivian Susane Eskenassis. Bolsa: CNPq. Março de 1984 a dezembro de 1988
- Magda Maria Ferreira Carvalho. Bolsa: CNPq. Janeiro de 1988 a janeiro de 1990
- César Borges Barros. Bolsa: CNPq. Março de 1995 a fevereiro de 2000.
- Marcelo André de Souza Baptista. Bolsa: CAPES. Agosto de 1995 a julho de 2000.
- Mauro Luiz da Hora Faria. Início: Agosto de 2001.
Tese de doutorado orientada por Ana Coelho:
- Carlos Augusto Gomes Soares. Bolsa: CAPES. Maio de 1994- dezembro de 2000
- Sonia Catarina de Abreu Figueiredo. Início: Agosto de 2001.
Orientação de Aperfeiçoamento em Genética:
- Simone Bucker Ribeiro- 1989
- Ângelo Mourão Filho- 1992
- Hernan Soto Gonzales- 1999-2001
Orientação de estagiários de Iniciação científica:
- Ana Teresa Nogueira Dumans- Jan. 1983- Fev 1984
- Ludmila Mueller Costa de Castro Leal- Jan. 1983 -Fev 1984. Bolsa do CNPq
- Vivian Susane Eskenassis- Jan. 1983- Fev. 1984
- Artêmio de Alencar Junior- 1986
- Antônio Galina Filho- Ago. 1986- Dez 1987. Bolsa do CNPq
- Cristiana Monteiro- 1987-1988
- Simone Bucker Ribeiro- 1988. Bolsa do CNPq
- João Lima Amarante (Santa Úrsula)- 1988- 1990. Bolsa do CNPq
- Cláudia Torres Ribeiro- 1989- 1990
- Carlos Henrique Lopes Alves- 1989- 1990
- Cláudia Borges- 1990
- Simone Henrique- 1991
- Angélica da Silva Barbosa- 1991
- Ângelo Mourão Filho- 1991- 92. Bolsa do CNPq
- Hadriane S.M.O. Albertos- 1992
- Marco Antônio Portilho Teixeira- 1992
- Luis Casaprima Gonzalez- 1993
- Robson Cardoso do Prado- 1991- 95. Bolsa do CNPq
- César Borges Barros- 1991 - 94. Bolsa RHAE
- Marcelo André de Souza Baptista - 1992- 95. Bolsa jovem pesquisador
- Cristina Elisa Alvarez Martinez- 1995- 96 CNPq
- Amaro E. Trindade Silva- 1997-1999 CNPq
- Eidy de Oliveira Santos- 2000-2001
- Lívia de Almeida Rodrigues- 2000
- Ingrid Horbach- 2001
- Rodrigo Agrellos- 2001
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Teses e monografias
- Isolamento e mapeamento físico do Tn4527, um transposon de S. typhimurium relacionado com o Tn7. Ana Teresa Nogueira Dumans. 1988.
- Detecção de um elemento de transposição de S. typhimurium (IS 4528) e mapeamento de uma região adjacente contendo o gene para resistencia a Km/Nm. Ludmila MCC. Leal. 1987.
- Tn4526: um transposon de S. typhimurium codificando resistencia à ampicilina. Vivian Susane Eskenassis. 1988.
- Análise da transposição do Tn4527. Magda Maria Ferreira Carvalho. 1990.
- Isolamento e análise intra-específica de Vibrio cholerae por ERIC-PCR e RAPD. Cesar Borges Barros. 2000
- Caracterização genético-molecular dos genes regulatórios toxR e toxS e identificação de outros loci do variante Amazonia de Vibrio cholerae em comparação com o genoma de Vibrio cholerae biotipo El Tor. Marcelo André de Souza Baptista. 2000
- Construção de uma biblioteca gênica de Vibrio cholerae El Tor e identificação de genes induzidos in vivo num sistema estuarino com o marisco Anomalocardia brasiliana. Doutorado. 2001.
Monografias de fim de Graduação- Departamento de Genética da UFRJ
- Ana Teresa Nogueira Dumans.
- Ludmila MCC Leal.
- Vivian Susane Eskenassis.
- Sequenciamento do IS Direito do Tn4527 e Observação deste em Linhagens de Salmonella typhimurium. Carlos Henrique Lopes Alves. Junho 1990.
- Análise Estrutural do Tn4526: um transposon que codifica resistência a ampicilina. Cláudia Torres Ribeiro. Junho 1990.
- Obtenção de Clones da Região Reguladora da Transposição do Tn4526. Cláudia M. Borges. Novembro 1990.
- Isolamento de Vibrios e outros bacilos gram negativos de siris e caranguejos da Baía de Guanabara. Marco Antonio Portilho Teixeira. Julho 1992.
- Desenvolvimento de método de diferenciação de espécies de Vibrio através de PCR de fragmento de 16S rRNA. Robson Cardoso do Prado. Fevereiro 1995.
- Análise molecular da região variável V1 do gene 16S rRNA de linhagens ambientais de Vibrio spp. César Borges Barros. Fevereiro 1995.
- Diversidade genética entre linhagens de Vibrio cholerae não -O1 detectada pelo método de PCR com
primers arbitrários. Marcelo André de Souza Baptista. Julho 1995.
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